1994年开始在生产中应用SPF剖腹产技术
1995年被农业部确定为全国农垦百家良种企业
1995年建设核心种猪场
1995年农业部重点科研课题“迪卡配套系种猪选育和利用”通过农业部专家验收
1996年引进丹系长白、英系大白和加系杜洛克种猪，开始专门化品系选育工作
1997年中荷畜牧示范培训中心建成，国务院副总理温家宝及荷兰王国农业部部长参加落成典礼并剪彩。
1997年建设种猪性能测定站，从法国率先引进ACEMA48型猪只采食自动记录系统
1997年开始中育配套系种猪培育研究工作
1998年开展配合力测定工作，初步确定中育配套系框架
1999年配套组装中育配套系
1999年建成600头规模的北京种猪资源场
2000年11月首次从法国伊彼得种猪优选公司引进374头种猪，经过45天的隔离检疫，于2001年1月3-5日转入北京种猪资源场，资源场正式投产。
2001年中心所属猪场使用GPS生产软件，使管理实现科学化、规范化
2002年11月中心所属北京原种猪场率先通过ISO9001：2000质量管理体系认证
2003年与大兴区畜牧局签订合作建设协议，为大兴区养猪场提供优质精液
2003年中心承担的跨越计划项目通过验收
2004年1月中心通过北京市农业标准化体系认证，获农业标准化先进单位称号
2004年4月中心所属南口种猪场和SPF种猪资源场，通过北京市农业标准化示范基地，分别获农业标准化合格单位称号
2004年“中育猪配套系”通过国家品种审定委员会的新品种审定
2004年实施省外扩张，与黑龙江省北大荒集团宝泉岭肉业有限公司合资组建黑龙江省宝泉岭农垦鑫元泉种猪繁育有限公司
2005年建成国内第一家多点式种猪选育场—北京长城丹玉畜产有限公司
2005年3月“中育猪配套系”获得农业部颁发的畜禽新品种（配套系）证书（农01新品种证字第8号）
2005年10月再次从法国引进原种猪350头
2005年中心所属中荷畜牧培训示范中心和建新东场通过北京市农业标准化示范基地验收，并获农业标准化先进单位称号
2006年建成农业部北方地区SPF种公猪站
2007年3月从英国引进纯种大白猪和长白猪100头
2007年3月通过 “AAAA级国家标准化良好行为企业”认证，成为养猪业首家“AAAA”级国家良好行为企业
2007年6月中心被农业部农垦局授予“全国农垦现代农业示范区”
2007年9月中心通过国家农业标准化示范基地验收
2008年4月8日中心正式划规北京三元种业科技股份有限公司管理
2009年2月14日北京养猪育种中心与大连福君牧业科技有限公司正式签订十年合作协议。2009年2月15日北京养猪育种中心近200头种猪安全抵达大连基地，北京三元种业养猪育种中心大连基地正式建产投产运营
2009年7月北京养猪育种中心与北京华都种猪公司正式合并
2010年5月 启动北京华都阳光生猪屠宰加工项目
2010年12月北京华都阳光食品屠宰加工项目投产运行

2011年1月 北京养猪育种中心被农业部、财政部授予“国家生猪产业技术体系—北京综合试验站”牌匾（2011-2015）

2011年9月 北京养猪育种中心原种猪场7553平方米猪舍改造工程通过竣工验收

2011年12月 北京养猪育种中心被农业部颁发“全国农业标准化示范县（农场）”、“国家生猪核心育种场”牌匾

2012年 7月中育种猪中荷猪场清群，清群后的中荷猪场定位为父系种猪试验场，主要饲养大白猪

2013年 4月引进695头美系大白、长白、杜洛克种猪，进入改造完成的中心所属原种猪场

2013年 8月所属原种猪场改扩建项目二期工程竣工并通过验收，项目总投资3557万元，总建筑面积17189.32平方米

2013年12月 中心完成的“猪人工授精技术集成创新与推广应用”项目，获全国农牧渔业丰收奖—农业技术推广成果奖二等奖

2015年 中育种猪承担的北京市农委科技项目“提高基础母猪年提供断奶仔猪头数技术集成与示范项目”，通过北京市农委组织的专家验收

2016年1月 中育种猪种公猪站投资226万元采购的全国配套法国卡苏进口精液自动化处理设备投入使用，设备包括全世界最先进的CASA精液分析系统。从此，中育种猪种公猪站精液从采集、稀释、灌装、封口、标签打印全部实现自动化、标准化

2016年3月 从荷兰海波尔种猪公司引进880头海波尔原种猪

2016年11月所属原种猪场被农业部中国动物疫病预防控制中心授予“国家动物疫病净化创建场”

2017年10月 被评为“高新技术企业”

2017年11月成立北京中育种猪有限责任公司大庆大同分公司

2018年北京养猪育种中心获“国家科学技术进步二等奖”

2020年4月成立北京中育种猪有限责任公司平谷分公司

2020年1月 中育种猪斥资59028万元，在平谷区和昌平区新建种猪场各1座，项目建成后，年可向行业提供优质项目种猪3万多头。

2020年11月南口种猪场实现当年开工建设当年投产运营，圆满完成了首农食品集团和北京市、区两级政府生猪保供目标任务。